Οι δύο αδελφοί,Ιωάννης και Αλέξιος,ίδρυσαν την Μονή Παντοκράτορος στο όνομα του Χριστού Παντοκράτορα το 1363 όπως αναγράφεται στην επιγραφή που βρίσκεται στη σκάλα προς το κωδωνοστάσιο. Η Μονή είναι χτισμένη πάνω σε βραχώδη λόφο,σε πολύ κοντινή απόσταση από την θάλασσα κοντά στην Μονή Σταυρονικήτα.
Στα τέλη του 14ου αιώνα με αρχές του 15ου περιήλθαν στη Μονή και άλλες μικρότερες μονές όπως η Μονή του Ραβδούχου, όπου υπάρχει ως κελί σήμερα στην περιοχή από τη Μονή Κουτλουμουσίου. Στο ναό του κελιού υπάρχουν τοιχογραφίες του 12ου αιώνα και ζωγραφιές τους 10ου αιώνα .Στη Μονή στεγάζεται βιβλιοθήκη καθώς και πλούσιο εικονοφυλάκιο. Η συλλογή φορητών εικόνων της Μονής είναι από τις σημαντικότερες του Αγίου Όρους με σημαντικότερους την εικόνα του Χριστού Παντοκράτορα(14ος αιώνας) και τον Γραπτό Σταυρό(14ος αιώνας).
Η Μονή γιορτάζει τη Μεταμόρφωση του Σωτήρος .